bashでのサブストリングの削除

Question

私は現在、複数のファイル名を同時に変更するためのbash正規表現を取得しようとしています。ここではファイル名は次のとおりです。

a_001_D_xy_S37_L003_R1_001.txt 
a_001_D_xy_S37_L003_R2_001.txt 
a_002_D_xy_S37_L006_R1_001.txt 
a_002_D_xy_S37_L006_R2_001.txt 
a_003_D_xy_S23_L003_R1_001.txt 
a_003_D_xy_S23_L003_R2_001.txt 

私は、結果としてこれをしたい：

a_002_D_xy_R1.txt 
a_002_D_xy_R2.txt 
... 

は、私が唯一の終わりに001.txt *を有するものを変更したいです。まず、_S .._ L00を削除します。ファイル名には001、最後には001となります。私はこの手順を2つに分割しました：

for file in *001.txt; 
do 
echo ${file#_S.._L..6} 
done 

このループはすでに機能しません。第二の代替として、私が試した：

for file in *001.fastq.gz; 
do 
echo ${file/_S.._L00./} 
done 

が、ファイル名は再び変更されません。 （私は結果を見るためにここでエコーを使用しています。動作すればmv ${file} ${regularexpression}と置き換えます） 助けてくれてありがとう！

Answer 1

まず、ファイルの数（n）を決定する必要があります。

n=$(ls *_001.txt | wc -l) 

functionRename(){ 

    for((i=1; i <=n; i++)) 
    do 
    file=$(ls *_001.txt | head -n $i | tail -n 1) 
    mv "${file}" "${file%_S??_*}${file#???????????????????}" 
    file2=$(ls *_001.txt | head -n $i | tail -n 1) 
    mv "${file2}" "${file2%_001*}.txt" 
    done 
} 

functionRename 

Answer 2

異なるフィールドがたくさん必要であることを考慮すると、ファイル名を分割して、必要に応じて再構成する方がよい場合があります。

元のファイル名を_に分割して作成した配列を使用することをお勧めします。次に、あなたが望むフィールドを使って新しい名前を再構築するだけです。 echoコマンドはちょうどデバッグのためのものです

for file in *001.txt; do 
     echo "FILE: $file" 

     IFS='_' read -r -a fileFields <<< "$file" 
     echo "FILE FIELDS: " 
     for index in "${!fileFields[@]}"; do 
      echo "- $index ${fileFields[index]}" 
     done 

     fileName="${fileFields[0]}_${fileFields[1]}_${fileFields[2]}_${fileFields[3]}_${fileFields[-2]}.txt" 
     echo "NEW FILE NAME: $fileName" 
     # mv $file $fileName 
    done 

あなたは、コードを理解すれば、あなたはそれらをすべて削除することができます。

しかし、実際にBASH式を使用して文字列を分割する必要がある場合は、 Extracting part of a string to a variable in bashの投稿を確認するか、BASH cheat sheetをご覧ください。