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基本的な例を調べると、Vennerable入力はベクトルのリストでなければならないことがわかりますhere。 は、だから、私はそこにバイナリp値行列を取り、バイナリ行列からR Vennerable Venn Diagramを実行するには？
library("Vennerable")
library('limma') # vennCounts, vennDiagram
library("psych")
ids <- seq(1,11)
M.cor <- cor(mtcars)
colnames(M.cor) <- ids
rownames(M.cor) <- ids
p.mat <- psych::corr.test(M.cor, adjust = "none", ci = F)
alpha <- 0.000000005
lista <- list(
as.vector(p.mat[["p"]] < alpha),
as.vector(p.mat[["r"]] < alpha),
as.vector(p.mat[["t"]] < alpha)
)
# List of 3 vectors
Vstem <- Venn(lista)
plot(Vstem, doWeights = TRUE, type = "circles")
図1の出力
間違った期待彼らの共通の特性に基づいて、ベン図を作成しようとする場所を次の手順を実行します出力：3つの円
STOUT
List of 3
$ : logi [1:121] TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE ...
$ : logi [1:121] FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE ...
$ : logi [1:121] FALSE TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE ...
Formal class 'Venn' [package "Vennerable"] with 2 slots
..@ IndicatorWeight : int [1:8, 1:4] 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 ...
.. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
.. .. ..$ : chr [1:8] "000" "100" "010" "110" ...
.. .. ..$ : chr [1:4] "1" "2" "3" ".Weight"
[email protected] IntersectionSets:List of 8
.. ..$ 000: NULL
.. ..$ 100: NULL
.. ..$ 010: NULL
.. ..$ 110: NULL
.. ..$ 001: NULL
.. ..$ 101: NULL
.. ..$ 011: NULL
.. ..$ 111: logi [1:2] TRUE FALSE
R：3.3.1
OS：Debianの8.5
交差ルックス好きなTRUE/FALSE（0/1）をラベルとして使用していますが、これは意図したものではないと私は疑います。代わりに 'which'を使ってラベルを取得してください。' which（p.mat [["p"]]
user20650
@ user20650正しいと思われます。私はあなたのことを参考にwikiを作った。それらの大きな0の領域はしかし、奇妙です。 –
ええ、かなりうまく見えません。私はこれがインストールされていないので、傾きのヘルプが、円のサイズがカウントにスケールされているように見えますが、交差が拡大縮小されていない：おそらくこれの引数がありますか？ [2番目の考えは、いくつかのケースでは、idを考えると、これらをスケーリングすると、セクションを配置するのが難しい（不可能ではないにしても）ようになります） – user20650