linux bashスクリプトのmodule loadコマンド

Question

HPCクラスタでPythonスクリプトを実行する必要があります。残念ながら、デフォルトのPythonバージョンは2.6.6で、numpyとscipyはありません。

私はそれが私に

を警告し、この

module load /home/hw1u16/modules/2.7.3 
module load /home/hw1u16/modules/1.6.2 
python /home/hw1u16/project/trainAgent.py 

のようなbashスクリプトを書くとき、私は、

#module load /home/hw1u16/modules/2.7.3 

と

module load /home/hw1u16/modules/1.6.2 

ただし、コマンドラインでこれらのモジュールをロードすることができ

ModuleCmd_Load.c(200):ERROR:105: Unable to locate a modulefile for '/home/hw1u16/modules' ModuleCmd_Load.c(200):ERROR:105: Unable to locate a modulefile for '/home/hw1u16/modules' 何が間違っているのか分かりませんが、どなたでも助けてくれますか？

Answer 1

さて、私は問題がどこにあるのか知っていると思います。シェルからtype moduleを試してください。moduleが現在システムにどのように定義されているかを確認してください。 2つのオプションが表示されます：エイリアスまたは機能のいずれかです。これは、moduleコマンドがaliasまたはshell functionであるためです。

は、スクリプトがあると言うrunning.sh次

は

#!/bin/bash 
module load python/2.7.3 
python /home/hw1u16/project/trainAgent.py 

は、この問題を整理するには（シェバングを追加することをお勧めします）あなたは2つのオプションがあります。

• をオプション1：

sourceはscitptです。言い換えれば、：source running.sh。これは、対話シェルに直接moduleコマンドを入力するのとまったく同じです。ただし、./running.shを実行すると、新しい非対話型シェルが実行されます。これらは、通常、標準のエイリアスとシェル関数が設定されていません。

• オプション2：

moduleコマンドを定義する初期化スクリプトを見つけ、sourceそのスクリプト