ルール内のコンダ環境パスを取得する方法は？

Question

以前のバージョンのSnakemake（3.9.1でbiocondaとの統合を使用してテストしました--use-conda）では、environment.yamlファイルのmd5ハッシュをチェックして、それぞれの環境をworkdir/.snakemake/conda/md5

バージョン4.3.0では、ファイルのmd5ハッシュが環境フォルダと一致しません。ソースコードを見ると、ハードコードされたパスでcondaエラーを避けるためにmd5ハッシュを計算するときに環境ファイルのフルパスが含まれていることがわかりましたが、正しいハッシュを生成する方法がわかりません。

ルール内で環境パスを取得するもう1つの簡単な方法はありますか？そうでなければ、環境を見つけるために正しいmd5をどのように生成できますか？

Answer 1

現在のところ、妥当な唯一の方法はログを確認することです。環境がアクティブになると、パスが表示されます。しかし、コマンドラインオプションを指定すると、すべての環境を一覧表示することができます（snakemake --list-conda-envsなど）。私はできるだけ早くそれをやります。

編集：私は--list-conda-envsをマスターブランチに実装しました。それは次のリリースになります。