r/sciplot：lineplot.CIのウィスカーが重複する

Question

sciplotライブラリでlineplot.CIを使用して相互作用プロットを作成すると、エラーバーが複数のグループにまたがることがあります。例えば、

data = c(1,5,3,7,3,7,5,9) 
grp1 = c(1,1,1,1,2,2,2,2) 
grp2 = c(1,1,2,2,1,1,2,2) 
lineplot.CI(grp1, data, grp2) 

グループがグループ化変数にジッタを追加し、TRUEにx.contを設定することにより、X軸に沿って分離することができ、これはプロットの線が消えることができる：

data = c(1,5,3,7,3,7,5,9) 
grp1 = c(1,1,1,1,2,2,2,2) + c(-0.05, -0.05, 0.05, 0.05, -0.05, -0.05, 0.05, 0.05) 
grp2 = c(1,1,2,2,1,1,2,2) 
lineplot.CI(grp1, data, grp2, x.cont=TRUE) 

エラーバーが重ならないように、ラインを表示してポイントをジッタさせることは可能ですか？それとも、このようなプロットを作る良い方法がありますか？

Answer 1

これにはggplot2を使用できます。以下は、標準のエラーやCIがないため、組み込みデータセットの例です。鍵はposition_dodge()です。

ToothGrowth$dose.cat <- factor(ToothGrowth$dose, labels=paste("d", 1:3, sep="")) 
df <- with(ToothGrowth , aggregate(len, list(supp=supp, dose=dose.cat), mean)) 
df$se <- with(ToothGrowth , aggregate(len, list(supp=supp, dose=dose.cat), 
       function(x) sd(x)/sqrt(10)))[,3] 

opar <- theme_update(panel.grid.major = theme_blank(), 
        panel.grid.minor = theme_blank(), 
        panel.background = theme_rect(colour = "black")) 

xgap <- position_dodge(0.2) 
gp <- ggplot(df, aes(x=dose, y=x, colour=supp, group=supp)) 
gp + geom_line(aes(linetype=supp), size=.6, position=xgap) + 
    geom_point(aes(shape=supp), size=3, position=xgap) + 
    geom_errorbar(aes(ymax=x+se, ymin=x-se), width=.1, position=xgap) 
theme_set(opar)