rJavaパッケージを使用して、Rから実行可能なJARファイルを実行しようとしています。このJARにはに/このようなjarファイル自体と同じパスにある外部フォルダからいくつかのファイルを読み書きすることがあります。rJava NoSuchFileException Rからjarを実行しています
mypath/myjar.jar
mypath/folder1
mypath/folder2
mypath/input_file1.txt
mypath/input_file2.txt
私はそれを呼び出す場合、プログラムは、コンソールを開いて、正常に動作します「mypathで」とjarを実行し、次の方法:
java -jar myjar.jar input_file1.txt input_file2.txt false
しかし、私はそれはどちらもmypathで/ folder1のを見つけることができないので、いくつかの点でrJava、コードがクラッシュを使用して、Rでこのコードを実行しようとするも作業ディレクトリが "mypath"として正しく定義されているにもかかわらず、mypath/folder2。実際には、Javaプログラムが呼び出され
jinit(".",force.init=TRUE) # this starts the JVM
.jaddClassPath("myjar.jar")
jobject <- .jnew("package_name/Main") ## call the constructor
result_java <- rJava::.jcall(obj = jobject, returnSig = "V", method = "main", c("input_file1.txt","input_file2.txt","false"))
が、それは実際にmypathでもある入力ファイルを見つけることができますが、何らかの理由でクラッシュのためにそれがmypathでのフォルダへの書き込みしようとしたとき(などのfolder1とfolder2)に次のエラーが表示されます。
Error executing task java.nio.file.NoSuchFileException: folder1/some_file.txt
実際に何が起こっているのかわかりません。私は本当にここで何かを見逃していますか?