各サブディレクトリ内のすべてのファイルの.txtを作成

Question

リスト内のすべてのファイルの各サブディレクトリにテキストファイルを作成する必要があります。
例えば、subdirectory1は、すべてのファイルのリストを.txtとし、subdirectory2にはsubdirectory2のすべてのファイルのリストが.txtとして含まれます。 私は試しました

#!/bin/bash 
for X in "$directory" * 
do 
    if [ -d "$X" ]; 
    then 
     cd "$X" 
     files="$(ls)" 
     echo "$files" >> filesNames.txt 
    fi 
done 

しかし、これは何も生成されませんでした。私は絶対にそれがパイプラインスクリプトの一部になるので、シェルスクリプトとして必要ですが、私はそれを動作させるように見えることはできません。

ここに、私にそのようなファイルやディレクトリのコメントを与えない調節されたスクリプトがあります。私は、フォルダが存在し、このコマンドの前に実行されるコマンドでそれを使用したことを知っています。

#!/bin/bash 

#Retrieve the base directory path 
baseDir=$(dirname "$ini") 

#Retrieve the reference genome path 
ref=$(dirname "$genome") 

#Create required directory structure 
tested="$baseDir/tested" 
MarkDups1="$baseDir/MarkDups1" 

#don't create if already exists 
[[ -d "tested" ]] || mkdir "$tested" 
[[ -d "MarkDups1" ]] || mkdir "$MarkDups1" 


#create a text file with all sorted and indexed bam files paths 
#!/bin/bash 
for x in $MarkDups1/*/; 
do 
    (cd "$x"; ls > filesNames.txt) 
done 

Answer 1

反復するシーケンスは"$directory"/*/である必要があります。

for x in "$directory"/*/; do 
    (cd "$x" 
    files=(*) 
    printf '%s\n' "${files[@]}" > filesNames.txt 
) 
done