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私は私のコードとしてこれを持っている:正規表現で数値を含む変数を使用するにはどうすればよいですか?
motifSearch = ''
intMin = 15
intMax = 21
intlen = intMax - intMin
SD = "TTGACA"
PBN = "TATAAT"
fastaFile = open('testseq.fsa', 'r')
for line in fastaFile:
if deviation == 0:
motSearch = re.search(SD+'([A-Z|a-z]){'+intMin,intMax+'}('+PBN+')', line)
if motSearch is not None:
motifSearch = motSearch.group(0)
print(motifSearch)
Iは、SDである第1の信号を見つけ、次に文字の{関数intmin、関数intmax}番号をジャンプし、次いで第二の信号PBNを見つけなければなりません。私がこれを印刷すると、私は次のようになります。 "TypeError:int型のオブジェクトをstrに暗黙的に変換できません"。 私は何が間違っていますか?
ありがとう!私はあなたの最後の解決策を使用しました。 motSearch = re.search( "{0}([AZ | az]){{1}、{2}}({0})は、フォーマット文字列で" (SD、intMin、intMax、PBN) しかし、それはなぜそう言われているのか分かりませんか? - 簡単な質問かもしれませんが、私はプログラミングにおいて非常に新しいです。 –
あなたが持っているPythonインタプリタのエラーを解決します。文字列フォーマットの他のメソッドは動作しますが、更新されたバージョンが私のためであるかどうかは分かりません。 –
ありがとうございます。 –