R出力から特定のテキスト行を抽出する

Question

R関数パッケージから得た結果から特定の情報を抽出しようとしています。私はPythonに慣れているだけなので、R言語を学ぶと私に混乱が生じます。これは私が必要とするすべてがちょうど最後の2つの数字（1から9）、およびそこから読み出される（それを印刷した後）appnnの出力、タンパク質凝集

今

Prediction: 
$sequence 
[1] "IFYFYGTTY" 

$overall 
[1] 1.076839 

$aminoacids 
      [,1] 
[1,] 1.076839 
[2,] 1.076839 
[3,] 1.076839 
[4,] 1.076839 
[5,] 1.076839 
[6,] 1.076839 
[7,] 1.028888 
[8,] 1.011057 
[9,] 1.011057 

$hotspots 
$hotspots[[1]] 
[1] 1 9 

を予測するパッケージであると仮定すると、

私はこれらの数字で決まる与えられた文字列の一部を抽出しなければなりません（この場合、文字列全体の長さは1から9までです）。

Pythonではかなりシンプルですが、私はRでそれを行う方法はわかりません。 多くのありがとうございます。

Answer 1

再現可能な例です。私は、この例のようpredictionsと呼ばれるあなたがappnnパッケージを使用してオブジェクトを作成している推測している：

library(appnn) 
sequences <- c('STVIIE','KKSSTT','KYSTVI') 
predictions <- appnn(sequences) 

今、ドキュメントは戻り値について何を言うん：

Value 

A list containing the amyloidogenicity propensity predictions for the 
polypeptides queried. 

    overall 
    The overall amyloidogenicity propensity prediction value for the sequence 

    aminoacids 
    The amyloidogenicity propensity prediction value per amino acid 

    hotspots 
    A list of the amyloidogenic hotspots predicted in the sequence, limited by the first and last amino acid 

だからここに私は」 3つのシーケンスを照会したので、私は3つの要素でRリストを返します。結果の要素を選択することで、それぞれの結果を得ることができます。最初は

> predictions[[1]] 
$sequence 
[1] "STVIIE" 

$overall 
[1] 0.9497568 

$aminoacids 
      [,1] 
[1,] 0.9497568 
[2,] 0.9497568 
[3,] 0.9497568 
[4,] 0.9497568 
[5,] 0.9497568 
[6,] 0.9497568 

$hotspots 
$hotspots[[1]] 
[1] 1 6 

名前付きコンポーネントの別のリストです。ホットスポット成分が（結果は配列のために複数のホットスポットとすることができる多分ため）、ただ一つの成分を持つリストそのものであるので、私は、このようにそれを得ることができる：

> predictions[[1]]$hotspots[[1]] 
[1] 1 6 

Rベクター（ベクターおよびリストを返すこと）は、長さ2の値が1と6の若干異なるものです。