SparkおよびHBaseの新機能です。私はHBaseテーブルのバックアップを取っています。これらのバックアップはS3バケットにあります。HBaseカラムに保存されたAVRO構造体を読み取る
conf.set("io.serializations", "org.apache.hadoop.io.serializer.WritableSerialization,org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.ResultSerialization")
val data = sc.newAPIHadoopFile(path,classOf[SequenceFileInputFormat[ImmutableBytesWritable, Result]], classOf[ImmutableBytesWritable], classOf[Result], conf)
問題のテーブルがEMPSと呼ばれている:私はこのようなnewAPIHadoopFileを用いたスパーク(スカラ)を介して、それらを読んでいます。 Empsのスキーマは次のとおりです。
key: empid {COMPRESSION => 'gz' }
family: data
dob - date of birth of this employee.
e_info - avro structure for storing emp info.
e_dept- avro structure for storing info about dept.
family: extra - Extra Metadata {NAME => 'extra', BLOOMFILTER => 'ROW', VERSIONS => '1', IN_MEMORY => 'false', KEEP_DELETED_CELLS => 'FALSE', DATA_BLOCK_ENCODING => 'NONE', TTL => 'FOREVER', COMPRESSION => 'SNAPPY', MIN_VERSIONS => '0', BLOCKCACHE => 'true', BLOCKSIZE => '65536', REPLICATION_SCOPE => '0'}
e_region - emp region
e_status - some data about his achievements
.
.
some more meta data
表には、単純な文字列データを持つ列と、AVRO構造を持つ列があります。
私はこのデータをS3のHBaseバックアップファイルから直接読み込もうとしています。私はテーブルが非常に大きいので、私のローカルマシンでこのHBaseテーブルを再作成したくありません。
これは私がこれを読んしようとしている方法です:期待
data.keys.map{k=>(new String(k.get()))}.take(1)
res1: Array[String] = Array(111111111100011010102462)
data.values.map{ v =>{ for(cell <- v.rawCells()) yield{
val family = CellUtil.cloneFamily(cell);
val column = CellUtil.cloneQualifier(cell);
val value = CellUtil.cloneValue(cell);
new String(family) +"->"+ new String(column)+ "->"+ new String(value)
}
}
}.take(1)
res2: Array[Array[String]] = Array(Array(info->dob->01/01/1996, info->e_info->?ж�?�ո� ?�� ???̶�?�ո� ?�� ????, info->e_dept->?ж�??�ո� ?̶�??�ո� �ո� ??, extra->e_region-> CA, extra->e_status->, .....))
として、私は正しく、単純な文字列データを見ることができますが、AVROデータがゴミです。
私はGenericDatumReaderを使用してAVRO構造読んでみました:
data.values.map{ v =>{ for(cell <- v.rawCells()) yield{
val family = new String(CellUtil.cloneFamily(cell));
val column = new String(CellUtil.cloneQualifier(cell));
val value = CellUtil.cloneValue(cell);
if(column=="e_info"){
var schema_obj = new Schema.Parser
//schema_e_info contains the AVRO schema for e_info
var schema = schema_obj.parse(schema_e_info)
var READER2 = new GenericDatumReader[GenericRecord](schema)
var datum= READER2.read(null, DecoderFactory.defaultFactory.createBinaryDecoder(value,null))
var result=datum.get("type").toString()
family +"->"+column+ "->"+ new String(result) + "\n"
}
else
family +"->"+column+ "->"+ new String(value)+"\n"
}
}
}
しかし、これは私に次のエラーを与えている:
- を:
org.apache.spark.SparkException: Task not serializable at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:298) at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.org$apache$spark$util$ClosureCleaner$$clean(ClosureCleaner.scala:288) at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.clean(ClosureCleaner.scala:108) at org.apache.spark.SparkContext.clean(SparkContext.scala:2101) at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:370) at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$map$1.apply(RDD.scala:369) at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:151) at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:112) at org.apache.spark.rdd.RDD.withScope(RDD.scala:362) at org.apache.spark.rdd.RDD.map(RDD.scala:369) ... 74 elided Caused by: java.io.NotSerializableException: org.apache.avro.Schema$RecordSchema Serialization stack: - object not serializable (class: org.apache.avro.Schema$RecordSchema, value: .....
は、だから私は聞きしたいの非直列化可能クラスを作る方法はありますかRecordSchemaはマップ関数で動作しますか?
- 私のアプローチは今のポイントですか?私はこの種のデータを扱うより良いアプローチについて知ってうれしいです。
- 私はこれをDataframeで処理する方がはるかに簡単だと読んでいます。私はこのように形成されたHadoop RDDをDataframeに変換しようとしましたが、そこでは盲目的に実行しています。