カラーパレットをrに調整する

Question

Rでは、データが0の周りにあり、データが1周ぐらいの場合、低い色を区別するために熱色を「再スケーリング」したいと思っています。これは虹の方法で行う必要があります。 "離散的な色"を望ましくない。私はimage.plotの中断を試みたが、うまくいきませんでした。

image.plot(X,Y,as.matrix(mymatrix),col=heat.colors(800),asp=1,scale="none") 

は、私が試した：

lowerbreak=seq(min(values),quantile2,len=80) 
    highbreak=seq(quantile2+0.0000000001,max(values),len=20) 
    break=c(lowerbreak,highbreak) 
    ii <- cut(values, breaks = break, 
      include.lowest = TRUE) 

    colors <- colorRampPalette(c("lightblue", "blue"))(99)[ii] 

Answer 1

colorRampPaletteを使用して、あなたが低い（または高い）の値を強調するためにbias引数を設定することができます。

「colorRampPalette(heat.colors(100),bias=3)」のようなものは、下に「ランプ」を合わせると視覚的に区別しやすくなります。

Answer 2

「スカッシュ」ライブラリを使用するアプローチは次のとおりです。 makecmap()では、色の値と区切りを指定し、baseパラメーターを使用してログの伸張を指定することもできます。ちょっと複雑ですが、きめ細かな制御が可能です。私は歪んだデータを色付けするために使用します。ここでは、「ローエンド」でより多くの定義が必要です。

虹色のパレットを実現するために、組み込みの「ジェット」カラー関数を使用しましたが、任意のカラーセットを使用できます。「colorRampPalette」でグレースケールランプを作成する例を示します。

どのようなランプを使用しても、データに最適化するためにはbase値で再生することができます。

install.packages("squash") 
library("squash") 

#choose your colour thresholds - outliers will be RED 
minval=0 #lowest value to get a colour 
maxval=2.0 #highest value to get a colour 
n.cols=100 #how many colours do you want in your palette? 
col.int=1/n.cols 

#create your palette 
colramp=makecmap(x=seq(minval,maxval,col.int), 
       n=n.cols, 
       breaks=prettyLog, 
       symm=F, 
       base=10,#to give ramp a log(base) stretch 
       colFn=jet, 
       col.na="red", 
       right=F, 
       include.lowest=T) 

# If you don't like the colFn options in "makecmap", define your own! 
# Here's an example in greyscale; pass this to "colFn" above 
user.colfn=colorRampPalette(c("black","white"))