フィールドに応じてファイルを分割して内容を編集する方法

Question

私はunixコマンドを使ってこれを行うことができるのか、pythonのようなもっと複雑なコードが必要なのかよくわかりません。

私は3つの列（id、異なる列（2列目）、異なるグループ（3列目））にグループ化された大きな入力ファイルを持っています。

Seq1  MVRWNARGQPVKEASQVFVSYIGVINCREVPISMEN  Group1 
Seq2  PSLFIAGWLFVSTGLRPNEYFTESRQGIPLITDRFDSLEQLDEFSRSF Group1 
Seq3  HQAPAPAPTVISPPAPPTDTTLNLNGAPSNHLQGGNIWTTIGFAITVFLAVTGYSF Group20 

私が希望： は、グループIDに従って、このファイルを分割し、グループごとに別々のファイルを作成します。各ファイルの情報を編集し、idの先頭に ">"記号を追加します。シーケンスの新しい行を作成する

Group1.txt file 
>Seq1 
MVRWNARGQPVKEASQVFVSYIGVINCREVPISMEN  
>Seq2 
PSLFIAGWLFVSTGLRPNEYFTESRQGIPLITDRFDSLEQLDEFSRSF 

Group20.txt file 
>Seq3 
HQAPAPAPTVISPPAPPTDTTLNLNGAPSNHLQGGNIWTTIGFAITVFLAVTGYSF 

どうすればいいですか？

Answer 1

このシェルスクリプトは、トリックを行う必要があります。

data.txtは、元のデータを含むファイルの名前です

#!/usr/bin/env bash 

filename="data.txt" 
while read line; do 
    id=$(echo "${line}" | awk '{print $1}') 
    sequence=$(echo "${line}" | awk '{print $2}') 
    group=$(echo "${line}" | awk '{print $3}') 
    printf ">${id}\n${sequence}\n" >> "${group}.txt" 
done < "${filename}" 

。

重要なことに、グループファイルは、スクリプトを実行する前に存在してはいけません。

Answer 2

AWKは、トリックを行います：

awk '{ print ">"$1 "\n" $2 >> $3".txt"}' input.txt