mac os xでmyrnaツールをダウンロードしようとしています。インストールの手順のいずれかの 、「(myrna_emrを含む)抽出したディレクトリを指すようにMYRNA_HOME環境変数を設定し、」Mac OS Xで環境変数を設定する方法
だから私は
は「輸出MYRNA_HOME =/... /エコーこの方法を試してみました。.. .. >>/~bashrc
しかし、これはうまくいきません(私がコマンドラインでMYRNA_HOMEをエコーすると、printenvと入力すると何もORが出ませんMYRNA_HOMEが出てこない)。
Env Varsを設定する方法を知っている人は誰ですか?
ありがとう、
ありがとうplabo!それは働く - btw、同様にこれを見てください。私はすでにR 2.13を持っていますが、myrnaはどこにいるのか分からないようです。だから私はRディレクトリのMYRNA_RHOMEでenv varを再度設定する必要があります。それは同じ方法でなければなりません。右?それは動作しません。 – nana
これを参照してください:MyrnaをHadoopクラスタまたはローカルコンピュータで実行するには、Myrnaが必要とするすべてのパッケージとともにR 2.10とBioconductorをインストールする必要があります。 R v2.10、Bioconductor、およびMyrnaがインストールされている場所を見つけることができない適切なパッケージがあれば、MYRNA_RHOME環境変数を適切なRホームディレクトリ、つまりbin/Rとbin /正しいインストールのためのRscript実行ファイル。 FASTQダンプをインストールしていない: をインストールしていない – nana
はR、とのエラーメッセージ、私は--test myrna_local実行すると、$ MYRNA_RHOME /Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.13/Resources/bin/ – nana