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os.walkを使用するスクリプトがあり、出力ファイルの最初の行に現在の作業ディレクトリを追加します。現在の作業ディレクトリを取得するためにos.path.realpathを追加しましたが、次のcsv.writerのコマンドは最初の行に出力を追加します。したがって、ディレクトリテキストの直後にcsv.writerを新しい最初の行には表示されません。私は「私が追加できることを知っている/ n」は新しい行で開始するが、どのように私はos.path.realpathコマンドに追加するには? おかげPython; csvライターは改行で始める必要があります
import os
import csv
from itertools import chain
from collections import defaultdict
def get_file_values(find_files, output_name):
for root, dirs, files in os.walk(os.getcwd()):
if all(x in files for x in find_files):
outputs = []
for f in find_files:
d = {}
with open(os.path.join(root, f), 'r') as f1:
for line in f1:
ta = line.split()
d[ta[1]] = int(ta[0])
outputs.append(d)
d3 = defaultdict(list)
for k, v in chain(*(d.items() for d in outputs)):
d3[k].append(v)
with open(os.path.join(root, output_name), 'w+') as fnew:
fnew.write(os.path.realpath(root))
writer = csv.writer(fnew)
for k, v in d3.items():
writer.writerow([k] + v)
get_file_values(['genes.gff.genespercontig.csv', 'hmmer.analyze.txt.results.txt'], 'output_contigsvsgenes.csv')
ありがとうございます! – Gravel