bsub pwd
のようなものを使用してジョブを送信するとします。今度は、その仕事の求人IDを取得して、次の仕事の依存関係を構築したいと思います。私がジョブIDを返すためにbsubを得ることができる何らかの方法はありますか?LSF - 提出されたジョブのIDを取得
8
A
答えて
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ちょうど参考に、これはこれまで私が思いつくことができる最高の解決策です。 bsubがIDを含む行をSTDOUTに書き込むという利点があります。
function nk_jobid {
output=$($*)
echo $output | head -n1 | cut -d'<' -f2 | cut -d'>' -f1
}
は使用法:あなたがC++を使用している場合は
jobid=$(nk_jobid bsub pwd)
0
$jobid = "0"
bsub pwd > $jobid
cat $jobid
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、あなたはジョブを送信するためにlsblib、LSFのC APIを使用することができます。入力と出力は構造体です。特に、出力構造体にはジョブIDが含まれています。
#include <lsf/lsbatch.h>
LS_LONG_INT lsb_submit (struct submit *jobSubReq, struct submitReply *jobSubReply)
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NilsとAndreyはそれぞれシェルとC/C++環境でこの特定の質問に対する答えを持っています。建物の依存関係の目的のために、あなたはまた、ジョブ名に基づいて依存関係を構築し、その後-Jとのあなたの仕事に名前を付けることができます。
bsub -J "job1" <cmd1>
bsub -J "job2" <cmd2>
bsub -w "done(job1) && done(job2)" <cmd>
もう少し情報hereがあります。
また、これはジョブ配列で動作します:
bsub -J "ArrayA[1-10]" <cmd1>
bsub -J "ArrayB[1-10]" <cmd2>
bsub -w "done(ArrayA[3]) && done(ArrayB[5])" <cmd>
あなたも、要素ごとの依存関係を行うことができます。
bsub -w "done(ArrayB[*])" -J "ArrayC[1-10]" <cmd3>
あなたは-w
hereに指定することができ、様々な事柄についての詳細情報を見つけることができます:ArrayB
内の対応する要素がDONE
状態に達したときに、次のジョブの私番目の要素にのみ実行されます。
0
提出後にJOBIDを表示したい場合は、ほとんどの場合、実行中のジョブと詳細を表示するためにbhistまたはbhist -lを使用します。
$ bhist
Summary of time in seconds spent in various states:
JOBID USER JOB_NAME PEND PSUSP RUN USUSP SSUSP UNKWN TOTAL
8664 F14r3 sample 2 0 187954 0 0 0 187956
どのような言語ですか? –
@AndreyRubshtein thats bash。 – jsmedmar
$(nk_jonid bsub $ VARIABLE)の中に変数を渡す方法がわかりました – jsmedmar