ImageJに3つのスタックを組み合わせる

Question

3つのスタックを「スタック結合」する方法はありますか？

画像>スタック>ツール>コンバイン

は2つのスタック、サイドバイサイドの組み合わせをサポートします。この周りの二つの方法：

• その後、最初の2を組み合わせる第三スタックに合成画像を組み合わせ
• は、上記

run("Combine...", "stack1=STAC1_NAME stack2=STACK2_NAME"); run("Combine...", "stack1=[Combined Stacks] stack2=STACK3_NAME");

を行うマクロを作成し、別の方法がありますこれは、例えば、20個のスタックを並べて組み合わせるためである。

コードスニペットは、ドキュメント、無による/

//Specify Folders here// 
output = "PATH"; 
combined = "PATH"; 
original= "PATH"; 

//Batch Mode for ImageJ 
setBatchMode(true); 
list = getFileList(input); 
for (i = 0; i < list.length; i++) { 
     combine(original, output, combined, list[i]); 
} 
setBatchMode(false); 
function combine(original, output, combined, filename) { 
//Open Outline & Overlay for Combine Stack// 
name_outline = filename + "_outline.png"; 
name_overlay = filename + "_overlay.png"; 
name_ellipse = filename + "_ellipse.png"; 
name_original = replace(filename, "_watershed.tif", ".tif"); 
open(original + name_original); 
run("RGB Color"); 
open(output + name_overlay); 
run("RGB Color"); 
open(output + name_outline); 
run("RGB Color"); 
open(output + name_ellipse); 
run("RGB Color"); 
run("Combine...", "stack1=filename stack2=name_overlay"); 
rename("combinedstack01"); 
run("Combine...", "stack1=name_outline stack2=name_ellipse"); 
rename("combinedstack02"); 
run("Combine...", "stack1=combinedstack01 stack2=combinedstack02"); 
saveAs("PNG", combined + filename + "_comb.png"); 
run("Close All"); 
} 

Answer 1

を追加しました：あなたは簡単にバッチ処理でスタック全体のフォルダが法を組み合わせることができますしかし

http://imagej.net/Stack_Manipulation

http://imagej.net/Stack-slice_Manipulations

参照：

http://imagej.net/Batch_Processingここ

例えばマクロ

例えば（パスを調整！ - スタックは、このスクリプト 'stack1'、 'stack2'、...）の名前です。

input = "C:\\Users\\test\\Pictures\\combine"; 
open("C:\\Users\\test\\Pictures\\combine\\stack1.tif"); 
rename("combinedStack"); 
list = getFileList(input); 
for (i = 1; i < list.length; i++){ 
    open(list[i]); 
    title=getTitle(); 
    run("Combine...", "stack1="+title+" stack2=combinedStack"); 
    rename("combinedStack"); 
}