bashループでR関数を実行する

Question

私はggplot_cnv.Rという名前のスクリプトをserval関数を含んでいます。

機能の一つは、入力としてファイルを取り、ggplot2プロットを出力します

plot.notch <- function(cnv_file, from=NA, to=NA) { 
... 
} 

私は複数のファイルでこれを実行できるようにしたいと思います。私はRscriptを使ってファイルをargとして渡してからggplot_cnv.Rの関数に送ることができますが、私のメインスクリプト（ggplot_cnv.R）でargsを使わないとこれを行う方法はありますか？

例えば、どのように私は、このような（これは動作しません）として、forループのbashでスクリプトggplot_cnv.Rからplot.notch関数を呼び出すことができます。

for f in $(ls data/*.cnv); do 
    Rscript -e "ggplot_cnv.R::plot.notch(cnv_file = $f)"; 
done 

Answer 1

私は多分あなたは、このような操作を行うためにR CMD BATCHを使用することができると思います作業。

Usage: 

    R CMD BATCH [options] infile [outfile] 

Answer 2

littlerプログラムは、お探しの機能を提供します。 http://dirk.eddelbuettel.com/code/littler.examples.html