どのように.h5ファイルを.csvに変換しますか？

Question

.tar.gzファイル形式の大きなデータセットをダウンロードしました。

アンパックすると、いくつかのフォルダのデータが生成され、個々のデータファイルは.h5ファイルの形式になります。データを.csvまたは.tsv形式に変換して、簡単にインポートしてRで使用できるようにする必要があります。

どのようにすればいいですか？

Answer 1

使用しているOSはわかりませんが、ここにはtarのマニュアルページがあります。 man tar

Answer 2

rhdf5（Bioonductor、CRANではなく）またはh5パッケージを使用して、.h5ファイルをRで読み取ることができます。多くの.h5ファイルにはスパース行列が含まれているため、ダウンストリームアプリケーションでは標準行列形式に変換する必要があります。