2017-03-23 8 views
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VirtualBoxのCentOS 7インストールにR RSpectraパッケージをインストールしようとしていますが、インストールがハングします。ここでは、シェルとR端子からいくつかのシステム情報です:VirtualBoxのCentOS 7でR Rspectraパッケージをコンパイルできません

[[email protected] ~]$ cat /etc/*-release 
CentOS Linux release 7.3.1611 (Core) 
NAME="CentOS Linux" 
VERSION="7 (Core)" 
ID="centos" 
ID_LIKE="rhel fedora" 
VERSION_ID="7" 
PRETTY_NAME="CentOS Linux 7 (Core)" 
ANSI_COLOR="0;31" 
CPE_NAME="cpe:/o:centos:centos:7" 
HOME_URL="https://www.centos.org/" 
BUG_REPORT_URL="https://bugs.centos.org/" 

CENTOS_MANTISBT_PROJECT="CentOS-7" 
CENTOS_MANTISBT_PROJECT_VERSION="7" 
REDHAT_SUPPORT_PRODUCT="centos" 
REDHAT_SUPPORT_PRODUCT_VERSION="7" 

CentOS Linux release 7.3.1611 (Core) 
CentOS Linux release 7.3.1611 (Core) 
[[email protected] ~]$ 


> Sys.info() 
          sysname        release 
          "Linux"   "3.10.0-514.10.2.el7.x86_64" 
          version        nodename 
"#1 SMP Fri Mar 3 00:04:05 UTC 2017"    "localhost.localdomain" 
          machine        login 
          "x86_64"       "vagrant" 
           user      effective_user 
           "root"        "root" 

> as.matrix(R.Version()) 
       [,1] 
platform  "x86_64-redhat-linux-gnu" 
arch   "x86_64" 
os    "linux-gnu" 
system   "x86_64, linux-gnu" 
status   "" 
major   "3" 
minor   "3.2" 
year   "2016" 
month   "10" 
day   "31" 
svn rev  "71607" 
language  "R" 
version.string "R version 3.3.2 (2016-10-31)" 
nickname  "Sincere Pumpkin Patch" 

は、そして、ここにそのインストールを示すRのコンソール出力がハングアップします:探し始めるところ

> install.packages("RSpectra", quiet=FALSE, verbose=TRUE) 
Installing package into '/usr/lib64/R/library' 
(as 'lib' is unspecified) 
system (cmd0): /usr/lib64/R/bin/R CMD INSTALL 
trying URL 'https://cran.uni-muenster.de/src/contrib/RSpectra_0.12-0.tar.gz' 
Content type 'unknown' length 426762 bytes (416 KB) 
================================================== 
downloaded 416 KB 

foundpkgs: RSpectra, /tmp/RtmpYHq9lV/downloaded_packages/RSpectra_0.12-0.tar.gz 
files: /tmp/RtmpYHq9lV/downloaded_packages/RSpectra_0.12-0.tar.gz 
During startup - Warning message: 
Setting LC_CTYPE failed, using "C" 
* installing *source* package 'RSpectra' ... 
** package 'RSpectra' successfully unpacked and MD5 sums checked 
** libs 
g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG -I../inst/include -I/usr/local/include -I"/usr/lib64/R/library/Rcpp/include" -I"/usr/lib64/R/library/RcppEigen/include" -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -c eigs_gen.cpp -o eigs_gen.o 

インストールがハングアップしているので、私は知りませんエラーのために。

sudo apt-get install -y libcurl4-openssl-dev 
sudo apt-get install -y libxml2-dev 

私は、RSpectraに似た解決策があると願っています。

答えて

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私はVagrantfileを使用してVMに多くのメモリを割り当てることによって、この問題を解決:

config.vm.provider "virtualbox" do |vb| 
# # Display the VirtualBox GUI when booting the machine 
# vb.gui = true 
# 
# # Customize the amount of memory on the VM: 
vb.memory = "4096" 
end 
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