辞書値を浮動小数点数に変換する

Question

私はPythonを初めて使う人です。私は問題を抱えており、私は立ち往生しています。情報はいくつかの辞書に保存されます。変数posはファイル内の浮動小数点ですが、pythonはそれを文字列として読み取ります。私はcompare_positions関数が呼び出されたとき、私はこのエラーメッセージを取得なぜこれがあるとします

Traceback (most recent call last): 
File "anotherPythontry.py", line 167, in <module> 
    iterate_thru(Genes,c,maxp,p) 
File "anotherPythontry.py", line 133, in iterate_thru 
    compare_positions(test_position,maxp,sn,g,p,c) 
File "anotherPythontry.py", line 103, in compare_positions 
    elif (testpos > maxpos and testpos <= maxpos+1): 
TypeError: unsupported operand type(s) for +: 'NoneType' and 'int' 

を私はpos、testpos、maxpos山車を作ってみたが、その後、私はTypeError: float() argument must be a string or a numberを取得します。私は問題が何であるか分かりません。ここで

は、コードは次のとおりです。事前に

def hasher(): 
     return collections.defaultdict(hasher) 

Positions = hasher() 
LODs = hasher() 
whole_line = hasher() 
InCommon = hasher() 

def save_info(line): 
    lod = line[7] 
    chr = line[2] 
    pos = line[3] #is a float in the file. Is read as a string though 
    snp = line[1] 
    item = line[10] 
    together = '\t'.join(line) 
    whole_line[item][snp]=together 
    Positions[item][chr][snp]= pos 
    LODs[item][chr][snp]=lod 
    return snp, item 

with open(sys.argv[3],"r") as geneFile: 
    gsnp_list = list() 
    Genes = [] 
    for line in geneFile: 
      line = line.strip().split("\t") 
      type1 = line[0] 
      if "SNP_id" or "Minimum" not in line: 
        if type1 == match: 
          snp,item = save_info(line) 
          gsnp_list.append(snp) 
          if item not in Genes: 
            Genes.append(item) 
# A similar block of code is for another file with phenotypes 

def compare_positions(testpos,maxsnp,gs,gene,p,c): 
    maxpos = Positions[p][c].get(maxsnp) 
    if testpos == maxpos: 
      InCommon[p][c][maxsnp][gene].append(gs) 
    elif (testpos > maxpos and testpos <= maxpos+1): 
      InCommon[p][c][maxsnp][gene].append(gs) 
    elif (testpos < maxpos and testpos >= maxpos-1): 
      InCommon[p][c][maxsnp][gene].append(gs) 

def iterate_thru(Genelist,c,maxp,p): 
    for g in Genelist: 
      for sn in Positions[g][c].keys(): 
        test_position = Positions[g][c].get(sn) 
        compare_positions(test_position,maxp,sn,g,p,c) 

for g in Genes: 
    for c in Positions[g].keys(): 
      chr_SNPlist =() 
      chr_SNPlist = [snp for snp in gsnp_list if snp == Positions[g][c].keys()] 
      maxp = get_max(chr_SNPlist,g,c) 
      iterate_thru(Phenos,c,maxp,g) 

感謝。

Answer 1

問題は、この行にある：

test_position = Positions[g][c].get(sn) 

特定の要求が整数と比較することができない結果None戻り、辞書にありません。この値は、エラーが発生した比較が行われたcompare_positionsメソッドに渡されます。

アプリケーションに応じて、ゼロなどのデフォルト値を試す可能性があります

test_position = Positions[g][c].get(sn, 0)