Python_Selecting longest AA sequence

Question

私は以下のシーケンスを持っており、最も長いシーケンスを選択しようとしています。私はそれが最初のシーケンスであることを知っていますが、M（開始）と*（停止）の間の最長距離を持つシーケンスをPythonが選択するようにするにはどうすればよいですか？あなたが始めるのは

First= MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV*  
Second= WRLSNRKPPLLLIPRLQKRRKRNLIRRLLTQNTILNIPYRTDGHSGFLKMIKAKLGKQTCG*SPSLILLKTFGLCTTISSCLVI*CLAVTTHFLRMVLSLCGKMRKTNGEDDG*LH*TNSRDEVTSIAFG*RHFCALLENLLMTTVMMYVALLLMLELKVIR*QYGLLNVKTEKLLHI*GGYTRKG*DFLQR**LVISPTQTQLLRAAPPLKIGLLF  
Third= GDCRTGNHPYS*SPDYRRGENGI*SGGC*PRTLY*TSPTEQMGTLVF*K**KQNLASKPAADLQV*YC*RLLGSVQPYPVV**FNAWL*LLTF*GWY*AYVGR*EKQTGRTMANYIEQTAETK*PRSLLARDTSVPYWRIF**LQ**CMWRCC*C*S*R**DSNMDY*M*KQRSCYTYREGIQGKVRTSSKDSDWLSVPRRHSY*ERLHH*K*VCCL  
Fourth= LNNKPIFSGGAALSSCVCVGLITNHYLWRKS*PFLVYPPYMCNSFSVFTFSSPYCYLITFSSNINNSATYIITVVIKRFSNKAQKCL*PKAIEVTSSLLFVQCN*PSSSPFVFLIFPHRLNTILKK*VVTARH*ITRQLDMVVQSPKVFNSIKLGDQPQVCLPSFAFIIFKKPECPSVL*GMFNIVFWVSNLLIRFRFLLFCSRGIRSRGGFRFDSRH  
Fifth= *TTNLFLVVEPLLVAVSAWD**PITIFGGSPNLSLYTLPICVTASLFSHSVVHIAILSPLALTLTTAPHTSSL*SSKDSPIRHRSVSSQKRSRSLRLCCLFNVISHRPPRLFFSSSHIGSIPSLKSE*SQPGIKLLDNWIWLYRAQKSSTVSNLEISRRFACQVLLLSFLKNQSAHLFCRGCLI*CSGLATS*LDSVFSSSVVGGLGVGVVSGSTVA  
Sixth= KQQTYF*WWSRS**LCLRGTDNQSLSLEEVLTFPCIPSLYV*QLLCFHIQ*SILLSYHL*L*H*QQRHIHHHCSHQKILQ*GTEVSLAKSDRGHFVSAVCSM*LAIVLPVCFSHLPT*AQYHP*KVSSHSQALNY*TTGYGCTEPKSLQQYQTWRSAAGLLAKFCFYHF*KTRVPICSVGDV*YSVLG*QPPD*IPFSPLL*SGD*E*GWFPVRQSP 

Answer 1

は、ここにあなたが興味を持っている長さを取得するために、いくつかの基本的なコマンドです。私は、各文字の最初に見つかった要素の間の長さをチェックする機能を定義しました。

First= 'MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV*' 
Second= 'WRLSNRKPPLLLIPRLQKRRKRNLIRRLLTQNTILNIPYRTDGHSGFLKMIKAKLGKQTCGSPSLILLKTFGLCTTISSCLVICLAVTTHFLRMVLSLCGKMRKTNGEDDGLHTNSRDEVTSIAFGRHFCALLENLLMTTVMMYVALLLMLELKVIRQYGLLNVKTEKLLHIGGYTRKGDFLQR**LVISPTQTQLLRAAPPLKIGLLF' 
Third= 'GDCRTGNHPYSSPDYRRGENGISGGCPRTLYTSPTEQMGTLVFKKQNLASKPAADLQVYCRLLGSVQPYPVVFNAWLLLTFGWYAYVGREKQTGRTMANYIEQTAETKPRSLLARDTSVPYWRIFLQCMWRCCCS*R**DSNMDYMKQRSCYTYREGIQGKVRTSSKDSDWLSVPRRHSYERLHHK*VCCL' 
Fourth= 'LNNKPIFSGGAALSSCVCVGLITNHYLWRKSPFLVYPPYMCNSFSVFTFSSPYCYLITFSSNINNSATYIITVVIKRFSNKAQKCLPKAIEVTSSLLFVQCNPSSSPFVFLIFPHRLNTILKKVVTARHITRQLDMVVQSPKVFNSIKLGDQPQVCLPSFAFIIFKKPECPSVLGMFNIVFWVSNLLIRFRFLLFCSRGIRSRGGFRFDSRH' 
Fifth= '*TTNLFLVVEPLLVAVSAWD**PITIFGGSPNLSLYTLPICVTASLFSHSVVHIAILSPLALTLTTAPHTSSLSSKDSPIRHRSVSSQKRSRSLRLCCLFNVISHRPPRLFFSSSHIGSIPSLKSESQPGIKLLDNWIWLYRAQKSSTVSNLEISRRFACQVLLLSFLKNQSAHLFCRGCLICSGLATSLDSVFSSSVVGGLGVGVVSGSTVA' 
Sixth= 'KQQTYF*WWSRS**LCLRGTDNQSLSLEEVLTFPCIPSLYVQLLCFHIQSILLSYHLLHQQRHIHHHCSHQKILQGTEVSLAKSDRGHFVSAVCSMLAIVLPVCFSHLPTAQYHPKVSSHSQALNYTTGYGCTEPKSLQQYQTWRSAAGLLAKFCFYHFKTRVPICSVGDVYSVLGQPPDIPFSPLLSGDE*GWFPVRQSP' 

def sequence_length(string, char1, char2): 
    try: 
     return string.index(char2) - string.index(char1) 
    except ValueError: 
     return None 

print(sequence_length(First, 'M', '*')) 
print(sequence_length(Second, 'M', '*')) 
print(sequence_length(Third, 'M', '*')) 
print(sequence_length(Fourth, 'M', '*')) 
print(sequence_length(Fifth, 'M', '*')) 
print(sequence_length(Sixth, 'M', '*')) 

戻り、この：

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