2017-09-08 19 views
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にR Essentialsの不足している依存関係私はcurrenty(インターネットへのアクセスを持たない仮想のLinux RedHatのマシン上でアナコンダのためのRの必需品のパッケージをインストールしようとしている通常のconda - オフラインプライベートリポジトリ

condaをインストールする理由ですc -r r-essentials

は機能しません)。これを行うには、2017-08/anaconda-server-sync-conda /ディレクトリのlinux-64-pkgs.tarファイルからダウンロードし、r(r \ pkgs \ linux-64)ディレクトリのみを使用しました。

その後、私はこのlinkの指示に従った。ディレクトリにはrepodata.jsonとrepodata.json.bz2が含まれていたため、this instructionに従ってファイルをビルドしてインデックスを作成する必要はありません。私は

condaを実行した後、R-必需品をインストール

はこれを起こる:

Fetching package metadata .... 
WARNING: The remote server could not find the noarch directory for the 
requested channel with url: file:///home/math/conda-r/repo.continuum.io/pkgs/r 

It is possible you have given conda an invalid channel. Please double-check 
your conda configuration using `conda config --show`. 

If the requested url is in fact a valid conda channel, please request that the 
channel administrator create `noarch/repodata.json` and associated 
`noarch/repodata.json.bz2` files, even if `noarch/repodata.json` is empty. 
$ mkdir noarch 
$ echo '{}' > noarch/repodata.json 
$ bzip2 -k noarch/repodata.json 
. 
Solving package specifications: 

PackageNotFoundError: Dependencies missing in current linux-64 channels: 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-base 3.2.1 -> ncurses 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-boot 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-class -> r-mass 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-cluster 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-codetools 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-foreign 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-kernsmooth 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-lattice 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-matrix 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-mgcv -> r-nlme >=3.1_64 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-nnet 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-rpart 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-spatial 
    - r-essentials -> r 3.2.1* -> r-recommended 3.2.1 -> r-survival 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-brglm -> r-profilemodel 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-gtools 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-minqa >=1.1.15 -> r-rcpp >=0.9.10 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-nloptr >=1.0.4 -> nlopt 
    - r-essentials -> r-caret -> r-bradleyterry2 -> r-lme4 >=1.0 -> r-rcppeigen 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-pbkrtest >=0.3_2 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-quantreg -> r-sparsem 
    - r-essentials -> r-caret -> r-car -> r-quantreg -> r-matrixmodels 
    - r-essentials -> r-caret -> r-foreach -> r-iterators 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-digest 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-gtable >=0.1.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-plyr >=1.7.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-proto 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-reshape2 -> r-stringr -> r-magrittr 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-reshape2 -> r-stringr -> r-stringi >=0.4.1 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-dichromat 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-labeling 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-munsell >=0.2 -> r-colorspace 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-scales >=0.2.3 -> r-rcolorbrewer 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-lazyeval 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-tibble -> r-assertthat 
    - r-essentials -> r-caret -> r-ggplot2 -> r-tibble -> r-rlang 
    - r-essentials -> r-caret -> r-modelmetrics >=1.1.0 
    - r-essentials -> r-data.table -> r-chron 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bh >=1.58.0_1 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-dbi >=0.3 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-r6 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bindrcpp -> r-bindr 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-bindrcpp -> r-plogr 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-glue 
    - r-essentials -> r-dplyr -> r-pkgconfig 
    - r-essentials -> r-glmnet 
    - r-essentials -> r-jsonlite 
    - r-essentials -> r-quantmod -> r-ttr >=0.2 -> r-xts >=0.9_3 -> r-zoo >=1.7_10 
    - r-essentials -> r-quantmod -> r-curl 
    - r-essentials -> r-randomforest 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-catools -> r-bitops 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-htmltools >=0.2.4 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-evaluate >=0.6 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-formatr 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-highr 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-markdown -> r-mime >=0.3 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-knitr >=1.6 -> r-yaml >=2.1.5 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-base64enc 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> r-rprojroot -> r-backports 
    - r-essentials -> r-rmarkdown -> pandoc >=1.15.0 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-httpuv >=1.3.2 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-rjsonio 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-xtable 
    - r-essentials -> r-shiny -> r-sourcetools 
    - r-essentials -> r-tidyr 
    - r-essentials -> r-irkernel -> ipython-notebook 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-irdisplay -> r-repr 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-rzmq >=0.7.0 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-uuid 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-pbdzmq >=0.2_1 
    - r-essentials -> r-irkernel -> r-crayon -> r-memoise 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-hexbin 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-htmlwidgets 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-maps 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-gistr -> r-httr >=1.0.0 -> r-openssl >=0.8 
    - r-essentials -> r-rbokeh -> r-pryr 
    - r-essentials -> r-broom >=0.4.1 -> r-psych -> r-mnormt 
    - r-essentials -> r-forcats >=0.1.1 
    - r-essentials -> r-haven >=1.0.0 -> r-hms 
    - r-essentials -> r-haven >=1.0.0 -> r-readr >=0.1.0 
    - r-essentials -> r-lubridate >=1.6.0 
    - r-essentials -> r-modelr >=0.1.0 -> r-purrr >=0.2.2 
    - r-essentials -> r-readxl >=0.1.1 -> r-cellranger -> r-rematch 
    - r-essentials -> r-rvest >=0.3.2 -> r-selectr 
    - r-essentials -> r-rvest >=0.3.2 -> r-xml2 
    - r-essentials -> r-tidyverse >=1.0.0 

Close matches found; did you mean one of these? 

    nlopt: r-nloptr 
    pandoc: pango 

(and similarly for the other packages) 

私も/ noarchディレクトリにファイルが*これらrepodataをコピーしますが、何もFetching package metadata ....の間の部分を除いて変更されません。 Solving package specifications:はここでは示しません。

パッケージの問題ですか、何か間違っていますか?

答えて

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私は同じ問題があります。しかし、違いはthe postに続き、必要なパッケージのみをダウンロードしたことです。しかし予期せず、私はパッケージr-baseがダウンロードされていないことがわかった。だから、もう一度ダウンロードしました。 次に、コマンドconda indexによってconda repoを構築しました。私は、次のコマンドを使用する場合:それはwork.IがデフォルトチャネルとR-ベースを更新してしまうことはありませんでした

conda install r r-essentials -c file:///opt/kevin/channel --override-channels 

enter image description here

(それは、インターネットを必要とします)