GNU並列：フォルダ内のすべてのファイルに対して1つのコマンドを並列実行する

Question

時間を節約するために、異なるパラメータで粒子シミュレーションを並列化しようとしています。したがって、私はGNUparallelを使用して、さまざまなパラメータのbashスクリプトを実行したかったのです。このスクリプトは、ファイルを読み込み、シミュレーションなどを行います。

$bash script <<< input file

しかし： -

$cd ~/parameter_files ls | parallel bash script <<< {}

がまったく動作しません。私はLinuxとGNUparallelの初心者ですので、誰かが助けてくれることを願っています。

Answer 1

あなたは~/parameter_filesディレクトリのファイルごとにこのようなparallelを使用することができます。

find ~/parameter_files -maxdepth 1 -type f -print0 | parallel -0 bash ../script 

• findコマンドは、シェルに各ファイル名を供給し~/parameter_filesディレクトリ内のすべてのファイルを検索し、NULが
• parallel -0 bash ...を終了し、それらを返します。スクリプトを実行して実行します。あなたは、ほぼ正しい

Answer 2

は、そうでない場合は、ここで文字列<<<は、個々のbash scriptコマンドではなく、parallelコマンドへの入力を供給するコマンド

ls | parallel "bash script <<< {}" 

の周りに二重引用符を使用

---

しかし、このユースケースは非常に珍しいですが、基本的にあなたのスクリプトがファイル名stリング。あなただけ引数としてファイルを渡したい場合はスクリプトに、あなたは

ls | parallel bash script 

か、標準入力

ls | parallel "bash script < {}"