反復処理が異なるOPに

Question

を与える私はこのPythonコードを使用して、私はのFastaに変換したいPHYLIP形式で複数のデータセットを（以下に指定）（以下に指定）はinput_sequences）のようになります。

8 1500\n 
\n 
sequence1 CTGTCCTTG...\n 
\n 
sequence2 CTGTCGTTG...\n 
\n 
sequence3 CTGCGTATG...\n 
\n 
sequence4 CTATGCCTG...\n 
\n 
sequence5 AGGTGTAAG...\n 
\n 
sequence6 AGGTGTAAG...\n 
\n 
sequence7 AAATTCAAA...\n 
\n 
sequence8 AAGTCCAAA...\n 
\n 

そして、これは私が見えるようにFASTAフォーマットでの私のoutput_sequencesを（）たいものです。

>sequence1 \n 
CTGTCCTTGG...\n 
>sequence2 \n 
CTGTCGTTGG...\n 
>sequence3 \n 
CTGCGTATGG...\n 
>sequence4 \n 
CTATGCCTGG...\n 
>sequence5 \n 
AGGTGTAAGG...\n 
>sequence6 \n 
AGGTGTAAGA...\n 
>sequence7 \n 
AAATTCAAAG...\n 
>sequence8 \n 
AAGTCCAAAA...\n 

私は上記のコードを実行すると、私はJ = 1の正しい出力が、次のJさん（2：9）を取得私は、この出力

\n 
>sequence1 *red inverted question mark*CTGTCCTTGG...\n 
>sequence2 *red inverted question mark*CTGTCGTTGG...\n 
>sequence3 *red inverted question mark*CTGCGTATGG...\n 
>sequence4 *red inverted question mark*CTATGCCTGG...\n 
>sequence5 *red inverted question mark*AGGTGTAAGG...\n 
>sequence6 *red inverted question mark*AGGTGTAAGA...\n 
>sequence7 *red inverted question mark*AAATTCAAAG...\n 
>sequence8 *red inverted question mark*AAGTCCAAAA...\n 

を（取得を...を継続シーケンスと反転赤です疑問符は、テキストラングラーに見えないものを表示するときに表示されるものです）。

一般的な質問と、なぜ私が混乱しているのは、なぜコードがj = 1では正常に動作するのか、それ以外の数字ではうまくいかないのでしょうか？そしてこの問題を解決するには？

ありがとうございます！

Answer 1

使用strip()とブールフィルタ：

with open('filename') as f: 
    lines = filter(bool, map(lambda x: x.strip(), f.readlines())) 

new_list = [] 

for values in lines: 
    for value in values.split(' '): 
     if value[0].isupper(): 
      new_list.append(value + '\n') 
     else: 
      new_list.append('>' + value + '\n')