配列を.binファイルに書き込むR

Question

Hei、後でFORTRANから呼び出すためにRの3次元配列を.binファイルに書き込もうとしています。

私は、次のアプローチを使用します。

my.array <- array(1:36, dim=c(3,4,3)) 

zz <- file("new.bin", "wb") 
writeBin (my.array,zz, size = 8) 
close(zz) 

をしかし、これはエラーメッセージを生成：私は考え出し

Error in writeBin(my.array, zz, size = 8) : can only write vector objects 

その私はのように、ベクターへの配列を平ら場合

writeBin (as.vector(my.array),zz, size = 8) 

writeBinがエラーメッセージなしで実行され、ファイルをFORTRANに読み込むことができます（How to write .bin file in R and open it in Fortranを参照）

しかし、私は巨大な配列を扱うので、オブジェクトの構造を保存することに興味があります。

オブジェクト構造を保持したままRに.binを書き込むことはできますか？

Answer 1

バイナリデータには「構造」がありません。オブジェクトの構造をバイナリデータにする場合は、手動で何かを追加する必要があります。たとえば、ファイルの先頭にいくつかのデータを追加することができます。

最初の数字は次元数Dです。次のD数値は各次元のサイズになります。残りのバイトはデータです。

だから、あなたの例のようなものになります：あなたのFortranコードで

writeBin(c(length(dim(my.array)), dim(my.array), my.array), raw(), size = 8) 
    [1] 03 00 00 00 00 00 00 00 03 00 00 00 00 00 00 00 04 00 00 00 00 00 00 00 03 
[26] 00 00 00 00 00 00 00 01 00 00 00 00 00 00 00 02 00 00 00 00 00 00 00 03 00 
[51] 00 00 00 00 00 00 04 00 00 00 00 00 00 00 05 00 00 00 00 00 00 00 06 00 00 
[76] 00 00 00 00 00 07 00 00 00 00 00 00 00 08 00 00 00 00 00 00 00 09 00 00 00 
[101] 00 00 00 00 0a 00 00 00 00 00 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 0c 00 00 00 00 
[126] 00 00 00 0d 00 00 00 00 00 00 00 0e 00 00 00 00 00 00 00 0f 00 00 00 00 00 
[151] 00 00 10 00 00 00 00 00 00 00 11 00 00 00 00 00 00 00 12 00 00 00 00 00 00 
[176] 00 13 00 00 00 00 00 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 
[201] 16 00 00 00 00 00 00 00 17 00 00 00 00 00 00 00 18 00 00 00 00 00 00 00 19 
[226] 00 00 00 00 00 00 00 1a 00 00 00 00 00 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 1c 00 
[251] 00 00 00 00 00 00 1d 00 00 00 00 00 00 00 1e 00 00 00 00 00 00 00 1f 00 00 
[276] 00 00 00 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 22 00 00 00 
[301] 00 00 00 00 23 00 00 00 00 00 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 

を、あなたは次元の総数を見つけるために、最初の数を読んでいました、D.そして、あなたが次のD番号を読んでいましたサイズまたは各次元を見つける。これで、Fortranで構造体を割り当て、残りのデータを読み込んですべての要素を埋めることができます。