annaconda envを使ってcrontabジョブを実行する

Question

私は、cronジョブでmy_envという名前の既存のanaconda python環境を使ってpythonスクリプトを実行させたいと思っています。私が考えることができるのは、cronジョブにmy_script.bashというスクリプトを実行させ、envを起動してからpythonスクリプトを実行することだけです。

#!/bin/bash 
source activate my_env 
python ~/my_project/main.py 

は動作しません、コマンドラインからこのスクリプトを実行しようとすると：私は、適切な環境が起動されたことを確認するために必要な何

$ sh scripts/my_script.bash 
scripts/my_script.bash: 9: scripts/my_script.bash: source: not found 

。私のようにそれを私に説明することが大丈夫です。

Answer 1

しかし、bashを呼んではいけません。 sourceはbashコマンドです。

- sh scripts/my_script.bash 
+ bash scripts/my_script.bash 

それとも、bashのシェバングを追加しましたので、ちょうど

chmod +x scripts/my_script.bash 
./scripts/my_script.bash 

。

Answer 2

私は最近、canopyからAnacondaに、cronジョブのenvを有効にしなくてはなりません。 AnacondaはPATH環境変数に基づいてこれを非常に簡単にします。 （私はminicondaを使用していますが、Anacondが完全にインストールされているわけではありませんが、アナコンダは同じ方法で動作するはずです）

2つの異なるアプローチがあります。

• 私はあなたを実装し、あなたのcrontabのトップ

  PATH=/home/users/user_name/miniconda2/envs/my_env/bin