Matlabのmexプログラムにさらにメモリを割り当てる

Question

私のC mexコンパイル済みファイルのメモリが不足しています（具体的には、mxMallocへの私の呼び出しは時々NULLを返します）。簡単な計算では、私のファイルはmxMallocに約500 MBのメモリ（おそらく1 GB）を求めていると推測し、Matlabをほとんど実行している64 GBのLinuxマシンでファイルを実行します。しかし、mxMallocは非常に頻繁にNULLを返します。

これは何らかの理由で（メモリの断片化など）発生する可能性がありますが、いずれの場合でも、500 MBは16 GBメモリのマシンから聞こえるほどではないようです。

mxMallocへの私の呼び出しは、Matlabのヒープからメモリを要求しますが、それについて100％は確信していません。（mxMalloc要求は結局Matlabによって処理され、OSによって直接処理されません。私のmexファイルの「ヒープ」サイズを増やす方法はありますか？

おかげ

Answer 1

あなたはmallocを使用することができます（ないmxMalloc）が、メモリ（例えばあなた必見コールfree; mxFreeがあるようにそれはオプションではありません）手動で管理する必要があります。また、C++とboostのshared/scopedポインタを使ってコンパイルを試みることもできます。 mexFunctionの署名には、extern "C"が前に付いている必要があります。

メモリが不足している理由の1つは、配列が長すぎることです。 mxArrayは連続したデータでなければなりません。そのため、mxMallocを入力すると、メモリ空間が断片化する可能性があります。 std :: vectorは連続していなければなりませんが、std :: listは必ずしもそうである必要はありません。

元のSTLのropeクラスのようなものも良い実装かもしれません。