devtools経由でrパッケージをインストールする際の問題install_github

Question

GitHubで2つのパッケージを開発中ですが、devtools::install_github()コマンドを使用してインストールしようとしています。

リポジトリはプライベートなので、私は自分のアカウントのauth_tokenを作成した（私の知る限り見るように、単一レポのためにこれを行う方法はありません？）

devtools::install_github("mariodejung/rMQanalysis", 
         auth_token="6cd2dbe8bd1f062842b90afXXXXXXXXXXXXXXXXX", 
         ref="develop", 
         dependencies=TRUE) 
devtools::install_github("mariodejung/cfpscripts", 
         auth_token="6cd2dbe8bd1f062842b90afXXXXXXXXXXXXXXXXX", 
         ref="develop") 

最初のパッケージのインストール2つ目はインストールを開始しますが、エラーで停止し、何らかの理由で既にインストールされている最初のパッケージについて言及しています。最後のコメントのエラーを見てください。 私はこれがなぜ起こり、それを解決するのか分かりません。

私はすでにいくつか変更して以来、以下のエラーメッセージを再度追加しました。

auth_tokenを変更して申し訳ありませんが、スクリプトは今のところプライベートにする必要があります。

1つのコマンドで両方のパッケージをインストールすることも確認しましたが、同じエラーメッセージが表示されます。私はまた、authトークンを公然と使用しないように、コメントから示唆されるように私の環境に変数を追加しました。

devtools::install_github(c("mariodejung/rMQanalysis","mariodejung/cfpscripts"), 
         ref="develop", 
         dependencies=TRUE) 

このコマンドは現在、正常rMQanalysisパッケージをインストールし、cfpscriptsのインストール中に同じエラーメッセージで失敗します。問題が何であるか把握する方法はまだ分かりません。他のマシンでも動作します。また、すべての依存関係がインストールされています。

devtools::install_github(c("mariodejung/rMQanalysis","mariodejung/cfpscripts"), ref='develop', quiet=FALSE) 
Using GitHub PAT from envvar GITHUB_PAT 
Downloading GitHub repo mariodejung/rMQanalysis@develop 
from URL https://api.github.com/repos/mariodejung/rMQanalysis/zipball/develop 
Installing rMQanalysis 
"C:/PROGRA~1/R/R-32~1.5/bin/x64/R" --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet CMD INSTALL \ 
    "C:/Users/cfproteomics/AppData/Local/Temp/RtmpktvmUK/devtools43850da641a/mariodejung-rMQanalysis-0e38dd3463ea830b19f0afa2ade6f2e14db93041" \ 
    --library="C:/Users/cfproteomics/Documents/R/win-library/3.2" --install-tests 

* installing *source* package 'rMQanalysis' ... 
** R 
** data 
*** moving datasets to lazyload DB 
** inst 
** tests 
** preparing package for lazy loading 
** help 
No man pages found in package 'rMQanalysis' 
*** installing help indices 
** building package indices 
** installing vignettes 
** testing if installed package can be loaded 
*** arch - i386 
*** arch - x64 
* DONE (rMQanalysis) 
Downloading GitHub repo mariodejung/cfpscripts@develop 
from URL https://api.github.com/repos/mariodejung/cfpscripts/zipball/develop 
Installing cfpscripts 
Downloading GitHub repo mariodejung/rMQanalysis@develop 
from URL https://api.github.com/repos/mariodejung/rMQanalysis/zipball/develop 
Error in stop(github_error(request)) : Not Found (404) 

私もtraceback()機能を使用しますが、それはより多くの洞察を与えるものではありません...

15: stop(github_error(request)) 
14: download_github(dest, src, auth) 
13: remote_download.github_remote(remote, quiet = quiet) 
12: remote_download(remote, quiet = quiet) 
11: FUN(X[[i]], ...) 
10: vapply(remotes, install_remote, ..., FUN.VALUE = logical(1)) 
9: install_remotes(object$remote[behind], ..., quiet = quiet) 
8: update.package_deps(pkg, ..., Ncpus = threads, quiet = quiet, 
     upgrade = upgrade) 
7: update(pkg, ..., Ncpus = threads, quiet = quiet, upgrade = upgrade) 
6: install_deps(pkg, dependencies = initial_deps, upgrade = upgrade_dependencies, 
     threads = threads, force_deps = force_deps, quiet = quiet, 
     ...) 
5: install(source, ..., quiet = quiet, metadata = metadata) 
4: FUN(X[[i]], ...) 
3: vapply(remotes, install_remote, ..., FUN.VALUE = logical(1)) 
2: install_remotes(remotes, quiet = quiet, ...) 
1: devtools::install_github(c("mariodejung/rMQanalysis", "mariodejung/cfpscripts"), 
     ref = "develop", quiet = FALSE) 

アップデート2

全体の問題はdevtools 1.12.0のバグのようです。それは1.11.1で正常に動作します。
rMQanalysisパッケージは、cfpscriptsにImports:と記載されています。このImports:文をDescriptionから削除すると、パッケージが正常にインストールされます。
私はまだinstall_githubが依存パッケージをインストールするのを防ぐためにdependencies=FALSEを設定できないのかと疑問に思っています。

私はすでにdevtoolsのバグレポートを記入しましたが、まだ反応はありません。

Answer 1

あなたは[あなたが支払ったので]リポジトリをダウンロードまたは複製しようとしましたか？

install.packages("/Path/to/source", repos=NULL, type="source") 

Answer 2

最新devtoolsバージョンの民間GitHubのリポジトリからインストールに関連するいくつかのバグがあります。私はissueを募集し、PRとしました。この問題の原因を見つけることができます。