私はGパッケージの特定の依存関係を持つRパッケージを持っています。ダウンロード時にRパッケージの外部依存関係をインストールすることは可能ですか?
通常、私は次のようにGitHubのからRパッケージをインストールします:
install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("github_repo/package_name")
Rパッケージで使用されるCコードのすべてが自然のサブフォルダpackage_name/src
の内側に位置しています。しかし、私は、Rパッケージが動作するために必要なCライブラリの依存関係をどのように解放するのか混乱しています。 「書き込みR拡張」のドキュメントに基づい
、https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-release/R-exts.htmlk、これらの依存関係がリストされるべきである:
「Rシステムへの外部依存が 『SystemRequirements』フィールドにリストされなければならない、おそらく別個のREADMEに増幅ファイル。"
これは意味があります。そして、私はREADMEにこれらのCライブラリの依存関係をインストールする方法や、githubリポジトリにライブラリを置くこともできます(大きすぎない場合)。
しかし、これは簡単にすなわちDockerfile
以内に、私は次のように追加することになり、私はドッカーファイルを好きな理由である、ダウンロードする人々のために混乱になることができます:
RUN apt-get update && apt-get install -y \
make \
clang \
require_c_library1 \
require_c_library2 \
require_c_library3
これらのCライブラリをロードすることは可能です(つまり、R CMD INSTALL
はR CMD SHLIB
を呼び出して、すべてのCコードとCの依存関係をMakevars
にインストールします)。
(1)RパッケージのC依存関係をすべてダウンロードして、devtools::install_github("github_repo/package_name")
にコンパイルするか、または(2)READMEにこれらの依存関係をすべてインストールするように頼むだけですそれは正しく(そして私に無限にメールを送りませんか?)
ので、私に
ダーン。 READMEに更新されたURLを入れておきます。 – ShanZhengYang