PyTableで列名を反復処理する方法は？

Question

PyTablesを使って大きな行列（15000行×2500列）を保存し、行の列を繰り返し処理する方法を見ています。 documentationでは、各行を手動で名前でアクセスする方法しか見ていません。

ID列の値が '10692.RFX7' は、他のすべてのような文字列である

• ID
• X20160730_Day10_123a_2
• X20160730_Day10_123b_1
• X20160730_Day10_123b_2：

  は、私のような列を持っていますセル値は浮動小数点数です。この選択作品と私は、結果の行を反復処理することができますが、私は列を反復し、その値を確認する方法を見ることができません。

  from tables import * 
  import numpy 
  
  def main(): 
      h5file = open_file('carlo_seth.h5', mode='r', title='Three-file test') 
      table = h5file.root.expression.readout 
  
      condition = '(ID == b"10692.RFX7")' 
      for row in table.where(condition): 
       print(row['ID'].decode()) 
  
       for col in row.fetch_all_fields(): 
        print("{0}\t{1}".format(col, row[col])) 
  
      h5file.close() 
  
  if __name__ == '__main__': 
      main() 
  

  私は「行にCOLのために」と繰り返す場合は何も起こりません。上記のコードがあるので、私はスタックを取得：

  10692.RFX7 
  Traceback (most recent call last): 
      File "tables/tableextension.pyx", line 1497, in tables.tableextension.Row.__getitem__ (tables/tableextension.c:17226) 
  KeyError: b'10692.RFX7' 
  
  During handling of the above exception, another exception occurred: 
  
  Traceback (most recent call last): 
      File "tables/tableextension.pyx", line 126, in tables.tableextension.get_nested_field_cache (tables/tableextension.c:2532) 
  KeyError: b'10692.RFX7' 
  
  During handling of the above exception, another exception occurred: 
  
  Traceback (most recent call last): 
      File "./read_carlo_pytable.py", line 31, in <module> 
      main() 
      File "./read_carlo_pytable.py", line 25, in main 
      print("{0}\t{1}".format(col, row[col])) 
      File "tables/tableextension.pyx", line 1501, in tables.tableextension.Row.__getitem__ (tables/tableextension.c:17286) 
      File "tables/tableextension.pyx", line 133, in tables.tableextension.get_nested_field_cache (tables/tableextension.c:2651) 
      File "tables/utilsextension.pyx", line 927, in tables.utilsextension.get_nested_field (tables/utilsextension.c:8707) 
  AttributeError: 'numpy.bytes_' object has no attribute 'encode' 
  Closing remaining open files:carlo_seth.h5...done 
  

Answer 1

あなたは各行の名前で列の値にアクセスすることができます。すべての列の上に

for row in table: 
    print(row["10692.RFX7"]) 

反復：

names = table.coldescrs.keys() 
for row in table: 
    for name in names: 
     print(name, row[name])