Pythonで開いたmha画像ファイル（2015年のチャレンジデータセット）

Question

私は卒業論文として医療画像のセグメンテーションのために深い学習を使いたい、2015年のチャット挑戦です。例えば

： MHA file

が、私はどのようにtensorflowフレームワークを使用し、使用python.Iによって.mhaファイルを開くにはしていないので、それは、Pythonを使用する方が便利だし、それ以外にも、私がする必要がありますデータグラフのいくつかの前処理を行います。その後

from medpy.io import load 
url = r'G:\path\to\mine.mha' 
mage_data,image_header = load(url) 

：

medpy.core.exceptions.DependencyError: Loading images of type Itk/Vtk MetaImage (.mhd, .mha/.raw) requires a third-party module that could not be encountered. Reason: No module named 'filter'. 

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悪童の課題は、私は私が私のネットワークを訓練するために使用することになってるものをネットワーク構造を知らない国際competition.Butです。あなたに良いアドバイスがあるなら、私に知らせてください。

Answer 1

これにはMedPyパッケージを使用できます。その後

sudo apt-get install python-pip python-numpy python-scipy libboost-python-dev build-essential 

：

sudo pip install nibabel pydicom medpy 

とPythonの使用法：

from medpy.io import load 
mage_data, image_header = load('/path/to/image.mha') 

ライブラリは、同様にいくつかの有用な前処理および分析機能をサポートしています。

幸運を祈る！