クラスタにジョブを送信するために、linuxを使用してヘッドレスでNetlogoを実行しようとしています。以前はLinuxを使ったことがありませんでしたが、私はここの指示に従っています(http://netlogo-users.18673.x6.nabble.com/Running-NetLogo-Headless-in-Behaviorspace-Sample-code-td4862232.html)。NetLogo netlogo-headless.shファイルの場所
#!/bin/bash
#SBATCH -N 1
#SBATCH -n 1
#SBATCH -c 7
module load netlogo/5.3.1-64
~/netlogo-5.3.1-64/netlogo-headless.sh \
-- model /cluster/home/rfuda01/UM_model.nlogo \
--experiment UM
--table /cluster/home/rfuda01/UM_test.csv
私は仕事を送信すると、出力ファイルは、というエラーメッセージが含まれています
line 7: /cluster/home/rfuda01/netlogo-5.3.1-64/netlogo-headless.sh: No such file or directory
は、私は、このファイルは私が指定したフォルダに配置されていないことがわかり、私はしたすべての例クラスタ上でNetLogoを使用するために見たこのスクリプトを参照してください。このファイルの正しいパスはどこにありますか?
はい、古い 'netlogo-headless.sh'を使うと動作しますが、メインのNetLogoディレクトリの下の' app/'ディレクトリから実行する必要があります。 –
ヘッドレススクリプトが見つかりましたが、新しいエラーが発生しました。「スレッド内の例外」main「java.lang.NoClassDefFoundError:org/nlogo/headless/main'ここで新しい質問を作成しました(http:// stackoverflow .com/questions/36266666/java-error-attempt-to-run-netlogo-headlessly-on-a-cluster) – bfuda