Rコマンドライン引数とメークファイル

Question

メイクファイルとコマンドライン引数を受け付けるRプログラムを組み合わせる際に問題があります 私はメイクファイルを書くのにはとても慣れていません。

サンプルを調理するだけです。 私はコマンドライン引数を受け取り、プロットを生成するRファイルを作成しました。 ここは私のファイルテストです.R

args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE) 
    if (length(args) != 1) { 
    cat("You must supply only one number\n") 
    quit() 
    } 
    inputnumber <- args[1] 
    pdf("Rplot.pdf") 
    plot(1:inputnumber,type="l") 
    dev.off() 

ここに私のMakefileがあります。

all : 
     make Rplot.pdf 
Rplot.pdf : test.R 
     cat test.R | R --slave --args 10 

今の質問は、私は 何かがこのメイクRplot.pdf等であってもよいと言うことができるように--args（この場合は10）を供給する方法である-10

私はその多くのメイクファイルを理解むしろRの質問である。

すべてのヘルプは大幅に次のように、名前付き引数を定義することができ

よろしく、

サヤン

Answer 1

ここには2つの質問があります。

最初の質問は、コマンドライン引数の解析に関するもので、既にサイト上でそれについていくつか質問がありました。検索するには "[r] optparse getopt"を検索してください。 R command line passing a filename to script in arguments (Windows)

Is there a package to process command line options in R?

、よりParsing command line arguments in R scripts

• 。

  2番目の質問は、基本的なMakefileの構文と使用法に関係しています。はい、ネットの周りにも多くのチュートリアルがあります。そして、あなたは基本的にそれをシェル引数に似ています。例えば以下の通りです。メイクファイルの一部（例：RInside）からRをコマンドラインフラグなどに問い合わせます。

  ## comment this out if you need a different version of R, 
  ## and set set R_HOME accordingly as an environment variable 
  R_HOME :=  $(shell R RHOME) 
  
  sources :=  $(wildcard *.cpp) 
  programs :=  $(sources:.cpp=) 
  
  
  ## include headers and libraries for R 
  RCPPFLAGS := $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config --cppflags) 
  RLDFLAGS :=  $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config --ldflags) 
  RBLAS :=  $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config BLAS_LIBS) 
  RLAPACK :=  $(shell $(R_HOME)/bin/R CMD config LAPACK_LIBS) 
  
  ## include headers and libraries for Rcpp interface classes 
  RCPPINCL :=  $(shell echo 'Rcpp:::CxxFlags()' | \ 
            $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave) 
  RCPPLIBS :=  $(shell echo 'Rcpp:::LdFlags()' | \ 
            $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave) 
  
  
  ## include headers and libraries for RInside embedding classes 
  RINSIDEINCL := $(shell echo 'RInside:::CxxFlags()' | \ 
            $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave) 
  RINSIDELIBS := $(shell echo 'RInside:::LdFlags()' | \ 
            $(R_HOME)/bin/R --vanilla --slave) 
  
  [...] 
  

Answer 2

を高く評価している：あなたはまた、Rscript test.R 10の代わりcat test.R | R --slave --args 10 を使用することができます

$ cat Makefile 
all: 
    echo $(ARG) 

$ make ARG=1 all 
echo 1 
1 

を。