ループ中のループを加速する

Question

次のwhileループを高速化する方法はありますか？

上記のコメントのように金額をワークアウト

count <- function(start, stepsize, threshold) { 
    i <- 1; 
    while (start <= threshold) { 
    start <- stepsize*i+start; 
    i <- i+1; 
    } 
    return(i-1); 
} 

system.time(count(1, 0.004, 1e10)) 

Answer 1

：

## start + S*n*(n-1)/2 = T 
## (T-start)*2/S = n*(n-1) 
## n*(n-1) - (T-start)*2/S = 0 

この二次方程式を解くための機能：このソリューションは、本質的に時間がかかりません

ff <- function(start,stepsize,threshold) { 
    C <- (threshold-start)*2/stepsize 
    ceiling((-1 + sqrt(1+4*C))/2) 
} 

...

> system.time(cc <- count(1, 0.004, 1e10)) 
    user system elapsed 
    5.372 0.056 5.642 
> system.time(cc2 <- ff(1, 0.004, 1e10)) 
    user system elapsed 
     0  0  0 
> cc2 
[1] 2236068 
> cc 
[1] 2236068 

qu estionは、これがあなたが解決する必要がある正確な問題に一般化するかどうかです。あなたがこれをやろうとしているよう

Answer 2

に見えます：

recount <- function(start, stepsize, threshold) { 
    NewCount <<- floor((threshold-start)/stepsize) 
} 
(fast <- system.time(recount(1, 0.004, 1e10))) 

は、それは、測定時間がかかりません。ここでは、グローバル変数なし

が、それは次のようになります。

recount <- function(start, stepsize, threshold) { 
    return(floor((threshold-start)/stepsize)) 
} 
(fast <- system.time(NewCount <- recount(1, 0.004, 1e10))) 

Answer 3

面白いブログはいくつかのヒントとRのループを高速化する方法がある

Another aspect of speeding up loops in R

ですそのページで報告されている例

NROW=5000 
NCOL=100 

#Ex. 1 - Creation of a results matrix where its memory 
#allocation must continually be redefined 
t1 <- Sys.time() 
x <- c() 
for(i in seq(NROW)){ 
    x <- rbind(x, runif(NCOL)) 
} 
T1 <- Sys.time() - t1 


#Ex. 2 - Creation of a results matrix where its memory 
#allocation is defined only once, at the beginning of the loop. 
t2 <- Sys.time() 
x <- matrix(NA, nrow=NROW, ncol=NCOL) 
for(i in seq(NROW)){ 
    x[i,] <- runif(NCOL) 
} 
T2 <- Sys.time() - t2 


#Ex. 3 - Creation of a results object as an empty list of length NROW. 
#Much faster than Ex. 1 even though the size of the list is 
#not known at the start of the loop. 
t3 <- Sys.time() 
x <- vector(mode="list", NROW) 
for(i in seq(NROW)){ 
    x[[i]] <- runif(NCOL) 
} 
T3 <- Sys.time() - t3 

png("speeding_up_loops.png") 
barplot(c(T1, T2, T3), names.arg = c("Concatenate result", "Fill empty matrix", "Fill empty list"),ylab="Time in seconds") 
dev.off() 

T1;T2;T3