私たちはJavaでWebサービスを開発し、wsdlを公開しました。これはhttpで行われます。これで、安全な接続（https）で提供する必要があります。 Webサービスアプリケーションはwebsphereにホストされており、websphereでhttpsに使用されている証明書を持っています。httpからhttpsへのWSDLの更新
httpsでWebサービスを公開できるように、Javaコードとwsdlを更新する手順を探しています。
JavaコードまたはWSDLを更新する必要はありません。これはすべてサーバー構成の機能です。サーバーはすでに通常のHTTPをリッスンしています（おそらくポート80でリッスンします）。リスナーはHTTPS用に追加する必要があります（おそらくポート443）。既存のアプリケーションと同じWebコンテキストにマップされます。
これは、Apache HTTP ServerやSSL/TLSオフロードをサポートする専用のロードバランサなどを使って、Webサーバー（あなたの場合はWebSphere）の外部で行うこともできます。
これは実際にプログラミングに関する質問ではないので、WebSphereの設定方法や上記で提案した設定に関する詳細については、http://serverfault.comに新しい質問をすることをお勧めします。