複数の.gzファイルの特定の列を一緒に貼り付けます。

Question

圧縮されていない行数と列数は同じです。

すべてのファイルは同じディレクトリにあります。

すべてのファイルから5〜6列ごとに引き出し、一時ファイルをダンプしなくても一緒に貼り付けることはできますか？あなたは一時ファイルを避けるために、bashのプロセス置換を評価し、使用するコマンドラインを作成することができます

for i in *.gz 
do 
    gunzip -c $i |cut -f5-6 >$i.tmp; 
done 

paste *.tmp 

おかげ

Answer 1

よう

何か：

command=paste 
for i in *.gz; do 
    command="$command <(gzip -cd $i | cut -f5-6)" 
done 
eval $command 

Answer 2

for f in *.gz ; do 
    printf '_fn %s\n' "$f" 
    gunzip -c "$f" 
done | 
    awk 'END { 
    for (i = 0; ++i <= m;) 
     for (j = 0; ++j <= fc;) 
     printf "%s", (d[j, i] (j < fc ? OFS : RS))  
    } 
    $1 == "_fn" { 
    fn = $2; fnr = x; ++fc 
    next 
    } 
    { 
    d[fc, ++fnr] = $5 OFS $6 
    fnr > m && m = fnr 
    }' OFS='\t'