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コードが動的にノードを追加した後は動作しませんが、あなたは追加のイベントに結合しなかったcytoscape.jsは、ノードdynamicalyを追加しますが、マウスオーバーは
// Mouseover function just give id node and position
cy.$('node').on('mouseover', function(evt) {
var myClickedID = evt.cyTarget.id();
console.log(myClickedID);
console.log(cy.$('#' + myClickedID).position());
});
// add a node dynamicaly
cy.$('node').on('click', function(evt) {
var elements = cy.add({
group: 'nodes',
data: { id: 'c' }
});
});