ggplot2でfacet_gridとgeom_rasterを使用する場合の行の塗りつぶし

Question

5つの場所（loc_1〜5）に異なる輝度値を生成する4つの測定/実験（M1..M4）を行いました。私は様々なクラスの要素を観察した（n = 7）。今度は、結果をggplot2のfacet_gridとgeom_rasterを使用して1つの図にまとめます。私は下の図で終わります（画像参照）。

ここで問題になるのは、行が各ファセットのスペースを埋める（つまり、各パネル内の未使用の行を削除する）簡単な解決策があるかどうかです。あなたの目標はあなたがtidyrパッケージなどからcomplete機能を使用することができますposmesure, elements, classの不足しているすべての組み合わせについて、NA値（または他の何か）を導入し、する場合

は

rm(list=ls()) 
library(ggplot2) 
library(reshape2) 

set.seed(123) 

# let's create a fake dataset 
nb.mesure <- 4 
n.row <- 200 
n.col <- 5 
nb.class <- 7 


d <- matrix(round(runif(n.row * n.col),2), nc=n.col) 
colnames(d) <- sprintf("Loc_%02d", 1:5) 

# These strings will be the row names of each heatmap 
# in the subsequent facet plot 
elements <- sample(replicate(n.row/2, 1:100)) 

# let's create a data.frame d 
d <- data.frame(d, 
       mesure = sort(rep(c("M1","M2","M3", "M4"), n.row/4)), 
       elements= elements, 
       class=sample(nb.class, 
          length(elements), 
          rep=T, 
          prob = seq(0.01, 0.25, length.out=7)) 
          ) 



# Data are melt 
dm <- melt(d, id.var=c("mesure", "elements", "class")) 
colnames(dm) <- c("mesure","elements", "class", "pos", "intensity") 

# Plotting 
p <- ggplot(dm, aes(x = pos, y = elements, fill = intensity)) 
p <- p + geom_raster()           
p <- p + facet_grid(mesure~class , scales = "free", space="free_y") 
p <- p + theme_bw() 
p <- p + theme(text = element_text(size=8)) 
p <- p + theme(text = element_text(family = "mono", face = "bold")) 
p <- p + theme(axis.text.y = element_blank(), 
       axis.ticks.y=element_blank(), 
       axis.text.x = element_text(colour="grey20", 
              size=6,angle=45, 
             vjust = 0.3)) 
print(p) 

Answer 1

ありがとうso：

library(tidyr) 

dm <- complete(dm, mesure, elements, class, pos, fill = list(intensity = NA)) 

場合

は、あなたが非NA値を持つようにしたいUPDATEを使用すると、facet_gridから離れるとfacet_wrapに切り替えて、各ファセットを埋めるために展開します。

p <- p + facet_wrap(mesure~class , scales = "free_y", nrow = 4)