slurm

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メンテナンス期間の準備として、すべてのSLURMノードを「排水」に設定した後、ノードが再開するまですべての新しいジョブが保留されたままになります。ただし、メンテナンスウィンドウの前でこれを行うので、実行中のジョブはすべて終了できます。それはかなりのクラスタ時間を無駄にする。 job start time + xが与えられた時間よりも短くなるように、ノードが--time=x引数を持つバッチジョブだけ

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SLURMで実行中のジョブの数を制限する

SLURMで複数のジョブをキューに入れています。 slurmの並列実行ジョブの数を制限できますか？ありがとうございます！

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は私が仕事を依頼するときに、私はSLURM</p> <p>にMathWorks社のMATLABでparpoolの作成に関するいくつかの問題を持っているSLURMでのMathWorks社のMATLABでparpool、ubuntu16.04サーバー

を作成することはできません、それが立ち往生します： parpoolサイズ：24この問題は担当者である場合は、MATLABのクラッシュダンプファイルが ------------------------------------------------------------------------ Segmentation violation detected at Sun Apr 2 1

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系統樹用ループ

私はRAxMLという系統発生ソフトウェアを使っていますが、私は各phylipファイルごとに1つのツリーを構築しています。 3個のPHYLIPのファイルとディレクトリのために、私は次のよう ##files in directory Ortho1.phy Ortho6.Phy Ortho6.Phy for f in /home/Single_trees/trimmed_alignment/*.p

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sacct：{CPUTimeRAWとCPUTime}を秒単位でリアルタイムに変換するにはどうすればよいですか？

私の目標は、CPUを割り当てた時間（秒）に基づいてユーザーに課金することです。それを測定するための最良のパラメータは何ですか？私は実行方法：例1： sbatch -N1 run.sh Submitted batch job 20 scontrol update jobid=20 TimeLimit=0-00:01 sacct -o totalcpu,cputime,cputimeraw

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Slurm：提出されたジョブのpidをsbatch経由で提供または変更することは可能ですか

sbatchでジョブをサブミットすると、インクリメンタルオーダーで指定されたジョブにpidが送信されます。この順序は私の観察に基づいて1から再び始まります。 sbatch -N1 run.sh Submitted batch job 20 //可能であれば、送信されたバッチジョブのIDを変更することです。 [Q1]たとえば、slurmの下で実行中のジョブがあります。ノードを再起動すると、ジョ

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SLURM - スクリーンに印刷する出力ファイルをエコーしますか？

当社のサーバはSLURMワークロードマネージャを使用しています。私はsbatchを使ってスクリプトを提出しています。現在、出力は#SBATCH -o /job_%j.outと#SBATCH -e /job_%j.errを使用してファイルに出力されています。 -eファイルをファイルに印刷するだけでなく、画面に印刷したいのですが。 .outと.errファイルを常に開いて更新する必要はなく、リアルタイム

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SlurmのJOBIDによるジョブの並べ替え

Slurmでは、与えられたユーザーのジョブを、JOBIDに従って昇順で並べ替えて、squeueとしたいと思います。私は squeue -u username --sort=+JOBID を試してみましたが、それは動作しません。あなたはなにか考えはありますか？

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LSFの配列ジョブ：種を設定していますか？

私は標準的な統計シミュレーションを実行しています。 100個の配列ノードの中で10000回の反復（それぞれが異なるランダムなシードを持つ）。これまで何度もやってきたことがありましたが、今度は100個のノードすべてがまったく同じ結果を出すようになりました。同じ種にすべてを設定できるLSFには微妙なものがありますか？私はRジョブを実行していますが、Rでシードを設定していません。アレイ内のジョブイン